A sustentabilidade ambiental está no DNA do Museu do Amanhã. Ele busca promover a reflexão de como é possível um modo de vida dos seres humanos que não esgote os recursos naturais ou altere o seu ecossistema a ponto de tornar inviável a vida humana neste planeta. As alterações no clima, a redução da biodiversidade, a extinção de biomas e o aumento da poluição nos mares e rios são alguns das consequência de uma exploração descontrolada da natureza. A realização de atividades que estimulem a reflexão e a prática da sustentabilidade são objetivos centrais do Museu do Amanhã.